Программирование на Python 2017 осенний семестр

Курс посвящен изучению основных элементов языка Python, де-факто являющегося на сегодняшний день стандартным решением для создания широкого класса скриптов. Помимо базовых конструкций и структур данных отдельное внимание будет уделено рассмотрению пакетов, ориентированных на реализацию и анализ алгоритмов обработки биоинформатических данных.

Преподаватель

Евгений Бакин

Темы занятий

1. Основные типы данных и конструкции языка Python 3.
2. Базовые алгоритмы работы с данными (сортировка, поиск, нахождение НОД и НОК, вычисление элементов ряда и пр.).
3. Работа с некоторыми распространенными форматами файлов (CSV, FASTA, FASTQ).
4. Парсинг строк. Регулярные выражения.
5. Наглядное представление данных: построение графиков, гистограмм, тепловых карт, диаграмм.
6. Возможности библиотеки BioPython.
7. Анализ и визуализация графов.
8. Работа с удаленными ресурсами: Encode, GEO, BLAST и пр.
9. Некоторые специальные конструкции языка Python: lambda, map, filter.
10. Поиск узких мест и ускорение вычислений. Мультипроцессинг.

Аттестация

1. Две контрольные работы: в середине и в конце семестра
2. N домашних заданий.

Материалы

• Слайды лекций
• Домашние задания
• Дополнительные материалы