Python весенний семестр 2018

Второй семестр курса посвящен изучению специальных элементов языка Python, де-факто являющегося на сегодняшний день стандартным решением для создания широкого класса скриптов. Особый акцент будет сделан на разработку прототипов тулов, решающих типовые биоинформатические задачи (анализ k-меров, сборка генома, закачка данных из удаленной базы и пр.).

Преподаватель

• Евгений Бакин

Темы занятий

1. Системы контроля версий. GitHub.
2. Основы объектно-ориентированного программирования в Питоне.
3. Создание классов для представления биоинформатических объектов (k-меров, элементов графа де Брюина и пр).
4. Построение графа де Брюина.
5. Работа с удаленными ресурсами: Encode, GEO, BLAST и пр.
6. Поиск узких мест и ускорение вычислений. Мультипроцессинг.
7. Создание графических интерфейсов в Питоне.

Аттестация: Контрольная работа в середине семестра. 7 домашних заданий.

---

Материалы

• Слайды лекций, домашние задания, дополнительные материалы